Istraživači iz Kine i Njemačke prvi put su u potpunosti dešifrovali genom krompira, prenosi TASS. To im je pomoglo da otkriju evolucionu istoriju biljke i identifikuju ključne delove DNK povezane sa rastom i otpornošću na bolesti. Informaciju o tome objavila je pres služba njemačkog instituta za oplemenjivanje bilja (IPZ).
“Razumijevanje genoma krompira omogućit će nam da pokrenemo visoko efikasne programe oplemenjivanja koji će stvoriti nove sorte koje su i visoke prinose i otporne na globalno zagrijavanje, što će biti kritično u narednim decenijama”, rekao je profesor IPZ-a Korbinian Schneeberger.
Uzgoj krompira otežavaju mnoge gljivične i bakterijske bolesti, kao i razne štetočine, poput koloradske zlatice i nematoda. Naučnici i uzgajivači pokušavaju da se bore protiv njih stvaranjem novih sorti običnog i genetski modifikovanog krompira.
Profesor Schneeberger i njegove kolege su dobili potencijalno rješenje ovog problema u sklopu velikog projekta čiji je cilj potpuno dešifriranje genoma krompira. U prošlosti su naučnici već pokušavali da dođu do ove informacije, ali je to otežala izuzetno složena struktura genoma krompira – sastoji se od četiri identična seta hromozoma koji sadrže veliki broj ponavljanja.
Nove tehnologije sekvenciranja DNK i algoritmi za analizu genetskih informacija pomogli su njemačkim i kineskim genetičarima da riješe ovaj problem za sortu Otava. Da bi dešifrovali genom, naučnici su prikupili veliki broj polenovih zrnaca, čiji genetski materijal sadrži samo dve, a ne četiri, kopije hromozoma.
Ovaj pristup je uvelike pojednostavio zadatak, ali je u isto vrijeme zahtijevao dešifriranje vrlo velikog broja fragmenata DNK i njihovu naknadnu kombinaciju korištenjem kompjuterskih algoritama. Na kraju, naučnici su dobili virtuelnu kopiju kompletnog genoma krompira, koji se sastoji od približno 3,1 milijarde genetskih „slova“-nukleotida i sadrži preko 38 hiljada gena.
Naknadna analiza njihove strukture otkrila je složenu evolucionu istoriju krompira. Naučnici su otkrili da je ova kultura relativno nedavno doživjela udvostručenje genoma kao rezultat inbreedinga. Osim toga, naučnici su otkrili neobične razlike u nivoima aktivnosti kopija istih gena koji se nalaze na različitim hromozomima, potencijalno utičući na efikasnost ukrštanja različitih sorti krompira.
Ove informacije, nadaju se naučnici, pomoći će razvoju novih sorti ili modificiranju genoma kako bi krompir brže rastao, bolje odolijevao kasnoj plamenjači i drugim bolestima, a bio će i manje podložan raznim faktorima stresa.