Inovativna metoda borbe protiv bolesti usjeva korištenjem lokalnih korisnih bakterija u tlu nastala je iz suradnje znanosti i industrije.
Tim naučnika iz Centra John Innes (UK) izolovao je i testirao stotine sojeva bakterija Pseudomonas iz tla sakupljenog sa farmi, a zatim sekvencirao genome njih 69.
Upoređujući genome sojeva koji inhibiraju aktivnost patogena s onima koji to ne čine, tim je uspio identificirati ključni mehanizam za zaštitu usjeva krumpira od štetnih bakterija.
Zatim su, koristeći kombinaciju hemije i genetike i niz eksperimenata, znanstvenici pokazali da je proizvodnja malih molekula zvanih ciklički lipopeptidi važna u kontroli krastavosti krumpira (bakterijska bolest koja uzrokuje značajnu štetu na usjevu krompira). Ove male molekule imaju antibakterijski učinak na patogene bakterije koje uzrokuju krastavost i pomažu korisnim bakterijama Pseudomonas da migriraju i koloniziraju korijenje biljaka.
Eksperimenti su također pokazali da navodnjavanje uzrokuje značajne promjene u genetski raznolikoj populaciji Pseudomonas u tlu.
Studija, objavljena u eLife-u, nudi metodu pomoću koje naučnici mogu proučavati mikrobiom gotovo bilo kojeg područja polja i uzeti u obzir različite uslove tla, agrohemijske i okolišne uvjete.
Koristeći napredak u brzom genetskom sekvenciranju, znanstvenici mogu testirati mikrobiom tla na korisne bakterije i odrediti koji se molekuli proizvode za suzbijanje patogena. Sljedeći korak je razmnožavanje i vraćanje korisnih mikroorganizama na isto polje.
Potencijalne primjene pojačivača mikrobioma uključuju primjenu bakterijskih koktela na površinu gomolja u obliku spreja ili direktno u tlo korištenjem navodnjavanja kapanjem.